Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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ZNF548Q8NEK5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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ZNF548Q8NEK5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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