Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLDN19Q8N6F1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CLDN19Q8N6F1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CLDN19Q8N6F1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CLDN19Q8N6F1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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