Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CLIP4Q8N3C7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CLIP4Q8N3C7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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