Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTF1AQ7RTS3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms