Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRNP1Q6NT89 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRNP1Q6NT89 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms