Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATG9BQ674R7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms