Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RTL8BQ17RB0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RTL8BQ17RB0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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