Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms