Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TWIST1Q15672 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TWIST1Q15672 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms