Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED1Q15648 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED1Q15648 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED1Q15648 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED1Q15648 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED1Q15648 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms