Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NR1D2Q14995 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms