Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPIDRQ14159 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SPIDRQ14159 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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