Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF2H3Q13889 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms