Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEUROD1Q13562 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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