Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TOP3AQ13472 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms