Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRSF5Q13243 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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