Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PRDM2Q13029 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRDM2Q13029 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms