Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HSPB3Q12988 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HSPB3Q12988 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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