Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms