Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MS4A2Q01362 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms