Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ERVFRD-1P60508 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms