Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CTBP2P56545 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTBP2P56545 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms