Protein–RNA interactions for Protein: P48047

ATP5O, ATP synthase subunit O, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5OP48047 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5OP48047 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms