Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD2P13995 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms