Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYH1P12882 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYH1P12882 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYH1P12882 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYH1P12882 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYH1P12882 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYH1P12882 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYH1P12882 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYH1P12882 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms