Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN25C9JDP6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN25C9JDP6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN25C9JDP6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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CLDN25C9JDP6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN25C9JDP6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN25C9JDP6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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