Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMNCA6NCL1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMNCA6NCL1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms