Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms