Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms