Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NXNL1Q96CM4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NXNL1Q96CM4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms