Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMPDL3AQ92484 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms