Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms