Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3156.6 ms