Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SVOPQ8N4V2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms