Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LNX2Q8N448 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms