Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
P3H3Q8IVL6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P3H3Q8IVL6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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