Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms