Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UVSSAQ2YD98 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms