Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSPP1Q1MSJ5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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