Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPROQ16827 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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