Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTF1Q16619 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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