Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GABRA6Q16445 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GABRA6Q16445 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms