Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms