Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms