Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TOP3AQ13472 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TOP3AQ13472 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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