Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME3Q13232 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME3Q13232 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME3Q13232 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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