Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPA4Q13156 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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