Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
GAGE1Q13065 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
GAGE1Q13065 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms