Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FOXL1Q12952 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms