Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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